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文本内容:
提取的实验报告「篇一」真核细胞rna真核细胞提取的实验报告rna实验原理根据成熟雌蟾蛛体内含大量卵细胞且可以方便获取,细胞内含核酸丰富,没有其它组织器官等的干扰等优点以确定蟾蛛卵细胞为实验所需的真核细胞通过TRIZOL溶液中变性剂破碎真核细胞,然后经过氯仿等有机溶剂抽提RNA,再利用RNA不溶于异丙醇的性质将自身析出,达到分离提纯的目的TRIzol的主要成分是苯酚苯酚的主要作用是裂解细胞,使细胞中的蛋白,核酸物质解聚得到释放苯酚虽可有效地变性蛋白质,但不能完全抑制RNA酶活性,因此TRIzol中还加入了8—羟基喳咻、异硫氧酸胭、0-筑基乙醇等来抑制内源和外源RNase(RNA酶)
0.1%的8—羟基喳琳可以抑制RNase,与氯仿联合使用可增强抑制作用异硫氟酸胭属于解偶剂,是一类强力的蛋白质变性剂,可溶解蛋白质并使蛋白质二级结构消失,导致细胞结构降解,核蛋白迅速与核酸分离3-筑基乙醇的主要作用是破坏RNase蛋白质中的二硫键甲基绿一吐罗红为碱性染料,它分别能与细胞内的DNA、RNA结合呈现不同颜色当甲基绿与吐罗红作为混合染料时,甲基绿与染色质中DNA选择性结合显示绿色或蓝色;毗罗红与核仁、细胞质中的RNA选择性结合显示红色其原因可能是两种染料的混合染液中有竞争作用,同时两种核酸分子都是多聚体,而其聚合程度有所不同甲基绿易与聚合程度高的DNA结合呈现绿色而吐罗红则与聚合程度较低的RNA结合呈现红色(但解聚的DNA也能和派洛宁结合呈现红色)即RNA对派洛宁亲和力大,被染成红色,而DNA对甲基绿亲和力大,被染成绿色094190D260=l时,RNA浓度约为=0D260X稀释倍数X401%甲醛变性胶电泳观察甲醛变性凝胶板
4.5ul RNA,120xxgX℃静置2h,4℃
1.7^
2.0,根据下述公式计算X甲醛胶电泳缓冲液,离心弃沉淀X10minX5min离心1之间,说明RNA浓度3%过氧化
3.5口137%甲2力口
0.2ml3niin,4℃15min3取上清,加入204℃,120xxg离心4弃上清,取沉淀,加入,7500g5弃上清,沉淀真空干燥6加40口
4.结果鉴定1紫外分光光度计检测取定260nm.280nm0D比值,如果比值在RNA纯度可标准样品当40n g/mlRNA浓度P g/mlo2电泳检测RNA质量,电泳槽及制胶板先用氢浸泡过夜;制K,2ul5醛,10ul甲酰胺,离心混匀,65℃变性15min后,迅速置冰浴中;再加入2ul RNA上样缓冲液,离心混匀后上样,6V/cm电压,电泳12h;暗室内紫外光下观察,〜拍照;如果观察到清晰的18S、28S RNA电泳带,无大量小分子RNA,说明RNA无明显降解,样品一70C保存备用
三、注意事项
1、所有玻璃器皿160180℃高温干烤6h以上,非耐高温器皿经
0.1%DEPC液〜浸泡后,经高温15磅,20min处理灭活RNA酶,所用试剂均用DEPC水配制,然后高压处理
2、实验用水要经DEPC处理,但含Tris的试剂不能用DEPC处理
3、实验操作过程中要戴一次性手套,以避免RNA酶污染药大0942605实验材料
(一)试剂
1.甲基绿一吐罗红染料
①染色剂A液的两种配制方法第一种方法取吐罗红甲基绿粉1g,加入到100mL蒸馆水中溶解,然后用滤纸过滤,将滤液放入棕色瓶中备用第二种方法取甲基绿2g溶于98mL蒸馈水中,取吐罗红G5g溶于95mL蒸储水中取6mL甲基绿溶液和2mL吐罗红溶液加入到16mL蒸储水中,即为A液,放入棕色瓶中备用(注意用于核酸染色的是吐罗红G,请不要错买吐罗红B)
②染色剂B液的配制方法B液是一种缓冲液,由乙酸钠和乙酸混合而成先取乙酸钠
16.4g,用蒸储水溶解至1000mL备用;再取乙酸12mL,用蒸储水稀释至1000mL备用取配好的乙酸钠溶液30mL和稀释的乙酸20mL,加蒸储水50mL,配成pH为
4.8的B液(缓冲液)
③染色剂的配制染色剂是由A液、B液混合配制而成的取A液20mL和B液80mL混合,就是实验中所用的吐罗红甲基绿染色剂应该注意的是该试剂应现配现用°
2.TRIZ0L试剂(Invitrogen公司购买)
3.75%乙醇
4.氯仿
5.异丙醇
6.Nacl
0.14m/l
(二)器材
1.离心机(3000r.p.m)
2.冰浴
3.研钵
4.烧杯
5.量筒
6.试管
7.玻棒
8.胶头滴管
99.离心管
10.天平实验方法制备匀浆以班级为单位,称取大概10g蟾蛛卵细胞(2~3c保存),于研钵(可置于冰浴锅上)中,根据10~30mg组织细胞加Imltrizol试剂的量加入其中,快速研磨,制备匀浆实验二人合作为一组,每组取大概10ml匀浆RNA的提取:取回匀浆后,室温静置lOmin,使样品充分裂解一一离心3000r.p.s20mins——取上清液移至新的离心管——加1/5TRIZOL溶液体积氯仿——在手中反复振荡摇匀,室温静置lOmin一一离心20mins——取上清液一一在上清中加入等体积冰冷的异丙醇,室温放置lOmin一一充分混匀,静置lOminute——离心20min——沉淀用75%乙醇洗涤两次定性试验取2支干净试管,一管加入
1.5MLRNA溶液将RNA颗粒状的沉淀溶于2ML
0.14/NACL溶液中,另一管加入蒸口水
1.5ML,像两管中加入3M甲基绿-毗罗红染色剂,溶液变成红色为阳性反应实验结果利用TRIZOL法可成功提取的RNA,并使得甲基绿-吐罗红染色剂显红色实验注意事项TRIzol对人体有害,使用时应戴一次性手套,注意防止溅出由于本科生实验室里的为普通离心机,转速不高,故可适当延长离心时间离心后,注意上清液和沉淀的取舍以及对RNA层的小心吸取,否则将导致RNA样品中有DNA污染真核细胞提取的实验报告「篇二」rna一.原理本方法利用盐酸胭抑制RNA酶,匀浆裂解细胞,采用有机溶剂抽提去除蛋白质通过选择性沉淀RNA分子去除DNAo二.方法
1.样品处理⑴组织样品处理取新鲜的组织样品称重后,剪碎成约lcm2的组织块直接加入匀浆液中进行RNA提取,或液氮中速冻-70C保存⑵贴壁培养细胞处理用PBS洗细胞一次,吸干溶液后将培养板快速移至液氮中冷冻后转到-70℃保存;或加入1ml匀浆至培养板中直接裂解细胞,然后将粘稠的裂解液进一步匀浆⑶悬浮培养细胞处理离心收集细胞,用PHS悬浮漂洗再田心收集,若不立即提取RNA,则可经液氮速冻后转至一70℃贮存备用
2.加1倍体积盐酸胭匀浆液[至准备好的样品细胞中,高速匀浆Imin
3.匀浆液5000g,室温离心lOmin
4.将上清移至一个干净离心管中,加入
0.1体积的3moi/L乙酸钠PH
5.2,混匀,再加5体积预冷的乙醇,立即充分混匀,-20℃放置至少2小时
5.5000g0℃离心10分钟沉淀核酸,弃上清液,室温干燥
6、每个提取RNA的组织或细胞样品中,加入1015min盐酸胭匀浆液II,搅拌〜溶解
7.加入
2.5体积预冷的乙醇,立即充分混匀,-20℃至少放置2小时
8.5000g0℃离心10分钟沉淀核酸,去上清,室温挥发乙醇
9.按每克组织细胞加5min的比例.分两次加入
0.02mol/L EDTApH
8.0先加1/2体积EDTA振荡12分钟,3000g离心2min.吸出上清.再加另一个1/2体积〜的EDTA振荡1一2分钟.合并两次核酸溶解液.
10.用等体积氯仿一正丁醇41抽提核酸溶液,5000g室温离心lOmin,5000g室温离心lOmino吸出上清至另一个干净离心管中
11.加3倍体积Imol/L乙酸钠PH
7.0混匀,-20℃放置lh以上,此时RNA将选择地沉淀,而DNA仍为溶解状况
12.5000g,0℃离心20min,沉于管底的是RNA
13.吸去上清,用4c预冷的Imol/L乙酸钠pH
7.0漂洗RNA沉淀然后20℃5000g,离心20分钟回收RNA
14.尽量去除上清液按每g组织细胞1m的比例加入RNA溶解液
0.2%SDS,
0.5%mol/L EDTA,pH
8.0注意若有SDS沉淀析出.滴力口
0.llmol/L NaOH调o溶液pH至
7.5o
15.加入2倍体积冰预冷乙醇混匀,0℃放置至少2小时,5000g,4c离心10分钟,RNA沉淀用70%乙醇漂洗,短暂离心后,弃上清,室温干燥蒸发乙醇
16.用适当小容积DEPC处理过的ddH20溶解RNA沉淀,加入3倍体积乙醇-70℃保存RNA备用用时.加入
0.1体积的3moi/L乙酸钠,混匀,120xxg,4℃离心回收RNA三.试剂
1.盐酸服匀浆液I成分8moi/L盐酸胭(分子量为
95.6),
0.Imol/L乙酸钠(pH
5.2),5mmol/L2一疏基乙醇,
0.5%十二烷基肌氨酸钠配制方法:取191g盐酸胭.加
8.35ml3mol/L乙酸钠(pH
5.2)和
6.25ml
0.2inol/L2一琉基乙醇溶液中,再加水至
237.5ml,混匀后加
12.5ml10%十二烷基肌氨酸钠,振荡混匀溶解
2.盐酸胭匀浆液n成分8mol/L盐酸胭(分子量力
95.6),
0.Imol/L乙酸钠(pH
5.2),Immol/L2一琉基乙醇,20mmol/L EDTA(pH
8.0)配制方法取191g盐酸月瓜,加日.35ml3mol/Io乙酸钠(pH
5.2)和
1.25ml
0.2mol/L2一筑基乙醇溶液中,再加入10ml
0.5mol/L EDTA(pH
8.0)加水至250ml0混匀
3.乙醇
4.70%乙醇
5.氯仿一正丁醇(41,体积比)
6.4mol/L乙醇钠,pH
7.
07.3mol/L乙醇钠,pH
5.
28.RNA溶解液成分:
0.2%SDS.
0.05mol/L EDTA,pH
8.0
四、说明提取RNA时,要特别注意防止RNase的污染,所用玻璃器皿均应用
0.1%的二乙基焦碳酸盐(diethyl pyrocarbonate,DEPC)处理塑料器材均使用一次性用品,并高压灭菌处理,必要时,也可用
0.KDEPC处理真核细胞提取的实验报告「篇三」rnaRNA是基因表达产物,由以下几类分子组成,rRNA(占细胞总RNA的80%85%)、〜tRNA和核内小分子RNA(占1015%)、mRNA(占1-5%)其中mRNA是分子生〜物学的主要研究对象,分离制备mRNA是克隆基因,分析基因表达以及建立cDNA文库的首要步骤真核细胞总RNA分离提取的目的是要获得高纯度的具有充分长度的RNA分子,包括RNA的纯度和完整性RNA分离的关键是尽量减少RNA酶的污染RNA酶活性非常稳定,分布广泛,除细胞内源性的RNA酶外,环境中也存在RNA酶因此在提取RNA时,应尽量创造一个无RNA酶的.环境,包括去除外源性RNA酶的污染和抑制内源性RNA酶活性主要是采用RNA酶的阻抑蛋白RNasin和强力的蛋白质变性剂盐酸胭或异硫氟酸胭抑制内源性RNA酶,采用焦碳酸二乙酯(DEPC)去除外源性RNA酶
一、RNA提取的关键真核细胞RNA的提取过程有四个关键点,即
①样品(细胞或组织)的有效破碎;
②有效地使核蛋白复合体变性;
③对内源RNA酶的有效抑制;
④有效地将RNA从DNA和蛋白混合物中分离;其中最关键的是抑制RN A酶活性提取的RNA可以用于核酸杂交、cDNA合成以及体外翻译等
二、组织RNA提取的基本步骤L仪器匀浆器、低温离心机、离心管
2.试剂氯仿、75%乙醇、异丙醇、DEPC溶液、1%甲醛变性胶、37%甲醛、3%过氧化氢、甲酰胺、RNA上样缓冲液
3.主要步骤1取组织50~100mg,加
0.8ml Trizol冲洗匀浆器,移入同一离心管,冰上静置5min0氯仿,充分震荡混匀,静置
0.5ml异丙醇,颠倒混匀一1ml75%乙醇溶液,漂洗沉淀lOmirio1DEPC溶液,充分溶解RNARNA溶解液,按一定比例稀释后,紫外分光光度计测值,计算0D260/0D280。