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PCR实验室开展哪些检验项目?这一篇够了!PCR实验室又叫基因扩增实验室,实时荧光定量PCR技术是DNA定量技术的一次飞跃,是用于放大特定的DNA片段,可看作生物体外的特殊DNA复制通过DNA基因追踪系统,能迅速掌握患者体内的病毒含量,其精确度高达纳米级别而实时荧光定量PCR则是实现该项技术的载体PCR实验常用来检验艾滋病、乙型肝炎、禽疫病等病毒感染性疾病,通过将病毒体内所含的基因进行扩增的方法,测出一些病毒含量不高的感染者体内是否含有特定的病毒PCR检测方法具有灵敏度高、特异性高、快捷、对样品要求低等优点,因此被临床医生广为认可,已广泛应用于医院的临床诊断和各防疫检测部门的禽疫病诊断在国家政策和疫情发展的推动下,各地区各级医院都开始或者准备建立独立合规的PCR实验室,都已具备核酸检测能力已经成为各医疗机构但由于各地区疫情的差异化使得长期低风险地区的一些核酸实验室除了具备应急功能之外几乎处于停滞状态此类情况也是各级医院领导在建立实验室最担心的问题,投入了资金和精力但又不能给医院带来创收PCR实验室其实功能极其强大,定性分析和定量检测是它最大的两个应用方向,那除了新冠核酸检测,我们万能”的PCR实验室还能做些什么呢?接下来就给大家展示几个具体应用方向的52-
53、-
56、-
58、-
59、-
66、-68和-81型毒亚型主要有HPV
6、
11、
30、
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42、43型及44型高危型HPV除可引起外生殖器疣外更重要的是引起外生殖器癌、宫颈癌及高度子宫颈上皮内瘤,其病毒亚型主要有HPV
16、
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56、58型和61型80%的子宫颈癌是由
16、
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31、45这4型HPV引起尽管有近百种HPV亚型,但临床上最重要的有HPV
6、
11、
16、
18、
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35、38型8个亚型是引起肛门外生殖器尖锐湿疣和宫颈病变的主要HPV亚型
1.巨细胞病毒常引起肺炎及器官移植病人的感染,为HCMV感染的早期诊断和鉴别诊断提供诊断依据
2.定量测定CMV-DNA有助于HCMV感染者抗病毒药物治疗的疗效检测监测
3.可用于器官移植、免疫缺陷患者、抗肿瘤治疗中HCMV感染的监测,器官移植后由于巨细胞病毒免疫抑制剂的使用,免疫缺陷和恶性肿瘤患者抗肿瘤治7巨细胞病毒核酸核酸疗造成免疫系统损伤,检测这些患者CMV-DNA有助于及时采取相应的治疗措施,避免严重后果
4.可用于死胎、畸胎、流产、低体重儿、婴儿肝炎综合症的病因学研究
5.用于CMV与肿瘤的关系研究:现认为CMV与宫颈癌、睾丸癌、前列腺癌、Kaposi肉癌、成纤维细胞癌、Wilms瘤与结肠癌等肿瘤的发生有关EB病毒是传染性单核细胞增多症的主要致病原,鼻咽癌、伯基特淋巴瘤、免疫低下或缺陷者B淋巴细胞恶性肿瘤、霍奇金病和移植后恶性淋巴瘤等均有阳性8/EB病毒核酸检测EB病毒DNA检测是EB病毒感染的辅助诊断,和其他肿瘤标志物联合检测,可有效提高鼻咽癌检出率,做到鼻咽癌的早发现,早诊断,早治疗EGFR突变10KRAS突变11BRAF突变
1.预测药物疗效EGFR是HER/ErbB家族信号通路的首要分子,吉非替尼、厄洛替尼等小分子TKI进入细胞内,直接作用于EGFR胞内的激酶区,干扰ATP合成,抑制酪氨酸激酶的活性,阻断激酶的自身磷酸化及底物的磷酸化,彻底阻断异常的酪氨酸激醛信号传导,从而阻止配体介导的受体及下游信号通路的激活,阻滞细胞在G1期,促进凋亡,抑制新生血管形成、侵袭和转移,达到治疗的作用小分子TKI的疗效与EGFR基因突变密切相关,是TKI疗效预测因子
2.预后评价根据是否使用EGFR-TKT对肺癌切除后患者进行预后分析,EGFR敏感性突变并服用TKI的患者至少在单因素分析中有预后良好的趋势但是,EGFR基因突变与女性、非吸烟者等这些传统的预后良好因子有交叉,只分析基因突变进行预后评价几乎是不可能的西妥昔单抗和帕尼单抗均通过直接抑制EGFR从而发挥抗肿瘤的作用,在结直肠癌和头颈部癌的靶向治疗中都有肯定的效果西妥昔单抗治疗的有效性受其下游基因KRAS状态的影响,突变型的KRAS无需接受上游EGFR信号即能够自动活化该通路并启动下游信号的转导只有KRAS基因野生型的患者才能从抗EGFR的治疗中获益,而突变型的患者则不能
1.BRAF是位于KRAS下游级联信号通路上的一个重要蛋白,当ERAF基因发生突变后,其编码生成的蛋白产物无需接受上游信号蛋白的活化便始终处于激活状态,启动下游细胞信号转导途径,引起细胞增殖,从而使EGFR抑制剂西妥昔单克隆抗体和帕尼单克隆抗体等疗效减弱或无效
2.BRAF基因可作为患者预后评价的独立性指标,BRAFV600E突变患者呈现预后更差的趋12PIK3CA突变13C-KIT基因突变检测14PDGFRA基因势
3.BREFV600E基因突变的黑色素瘤患者对维罗非尼治疗有效
1.PTK3CA突变的肿瘤细胞对EGFR或ERBB2通路的靶向药物拉帕替尼Lapatinib会产生耐药性
2.研究表明HER2靶向治疗药物赫赛汀对PIK3CA基因突变的人群疗效欠佳
3.单抗类EGFR抑制剂西妥昔单抗、帕尼单抗和拉帕替尼药效预测
1.辅助诊断和预测疗效伊马替尼是一种酪氨酸蛋白酶抑制剂,能阻断酪氨酸蛋白激酶KIT受体功能,从而抑制肿瘤的形成已有研究证实,C-KIT基因突变的位置能影响肿瘤患者对伊马替尼、舒尼替尼等酪氨酸激能抑制剂的反应通过检测C-KTT基因的突变状态,协助GIST诊断,也可以进一步的明确诊断CD117阴性的患者,诊断家族性GIST评价小儿GIST指导化疗,预测化疗效果2预后评价当C-KIT基因第11外显子发生突变后,患者预后较发生于C-KIT基因其他外显子或PDGFRA基因突变的患者或者未检测到C-KIT基因或PDGFRA基因突变的患者预后更差来源于小肠或结肠的GIST如发生C-KIT基因第9外显子突变,较发生C-KIT基因第11外显子突变者更具有侵袭性
1.辅助诊断和预测疗效伊马替尼是一种酪氨酸蛋白酶抑制剂,能阻断酪氨酸蛋白激酶KIT受体功能,从而抑制肿瘤的形成已有研究证实,PDGFRA基因突变的位置能影响肿瘤患者对伊马替尼、舒尼替尼等酪氨酸激酶抑制剂的反应研究表明PDGFRA基因外显子12和外显子18大部分基因位点突变后使用伊马替尼、舒尼替尼等酪氨酸激酶抑制剂治疗时GIST患者可从中获益但如外显子18基因位点发生D842V、RD841-842KI15EML4-ALK融合基因检测或D1842-843IM突变使用伊马替尼、舒尼替尼等酪氨酸激酶抑制剂治疗时GIST患者不能从中获益
2.预后评价当PDGFRA基因发生突变后,肿瘤侵袭性较发生于KIT基因突变的患者侵袭性低
1.ALK抑制剂克里H坐替尼能够作用于该基因的下游信号传导通路并拮抗其促肿瘤生成活性,其n期临床试验中客观缓解率为64悦疾病控制率为90%疗效显著
2.预测药物疗效EML4-ALK融合基因阳性的NSCLC患者接受以钳类为基础的化疗,其有效率、疾病进展时间和总生存期与EGFR突变或同时包含EML4-ALK融合基因EGFR野生型的NSCLC患者相似相反,EML4-ALK融合基因者不能从TKI的基础治疗中受益,表现为耐药,结果与无EGFR基因突变的患者相似
3.预后评价携带EGFR基因野生型肺腺癌患者,EML4-ALK融合基因预示患者的总生存期更长16HER2基因HER2基因扩增状态是乳腺癌患者预后判断及制订有效治疗方案的先决条件,对乳腺癌的诊疗具有重要的指导作用1预后评价研究显示,HER2基因的过表达除了与肿瘤的发生发展相关外,还是一个重要的临床预后指标,主要表现为HER2基因扩增的乳腺癌浸润性强、无进展生存期progressfreesurvival、PFS短、预后差而且这部分患者就诊时的肿瘤负荷更大,淋巴结转移的几率更高,激素受体阴性的比例更高、组织学分级更差、肿瘤的增殖指数更高、复发风险更高但没有证据显示HER2基因扩增与导管原位癌ductalcarcinomainsituDCIS的预后相关2内分泌药物疗效预测研究显示,相对于无HER2基因扩增的乳腺癌患者而言,HER2基因扩增的患者应用他莫昔芬治疗后的死亡风险明显增高,因此这类乳腺癌患者可能不适合选择他莫昔芬作为内分泌治疗,而且HER2基因扩增的乳腺癌患者对CMF化疗方案的反应性降低,宜采用高剂量的慈环类药物方案
(3)靶向药物疗效预测大量临床研究数据提示,使用曲妥珠单克隆抗体等治疗乳腺癌时,无论是与常规化疗联合用于乳腺癌患者的辅助治疗,还是用于辅助治疗后的维持治疗及用于晚期乳癌患者的单药或联合治疗,都能肯定改善HER2基因扩增或蛋白过表达患者的生存,使乳腺癌患者获益即使在使用曲妥珠单抗治疗过程中出现疾病进展而需要进一步治疗的乳腺癌患者,继续使用曲妥珠单抗治疗仍然有效而对于HER2基因低度扩增或不扩增的乳腺癌患者,使用曲妥珠单抗疗效不佳
1.疗效预测MGMT启动子发生甲基化的患者明显比未发生甲基化的患者使用烷化剂的疗效好,其总体生存率和无进展生存率更高MGMT启动子区甲基化对胶质瘤一线化疗药物TMZ治疗胶质瘤的化疗疗效具有预测价值,且是独立的预后较好的指示指标MGMT启动子17/MGMT基因甲基化检测未甲基化者从TMZ常规治疗方案中获益较小,应对这类患者采用更有效的有助于克服耐药的其他化疗方案
2.预后评价40%脑胶质瘤患者有MGMT启动子甲基化,甲基化程度越高,预后越差,其对肿瘤的预后和生存期的预示作用较肿瘤的分级、临床、年龄等其他特征更有效
1.无创DNA产前检测技术仅需采取孕妇静脉血,利用新一代DNA测序技术对母体外周血浆中的游离DNA片段(包含胎儿游离DNA)进行基因测序,并将测序结果进行生物信息分析,可以从中得到胎儿的遗传信息,从而发现胎儿21号、18号、13号染色体是否存在非整倍体异常
2.适用人群
①血清学筛查显示胎儿常见染色体非整倍体风险值介于高风险切割值与1/1000之间的孕妇;
②有介入性产前诊断禁忌证者(如先兆流产、发热、出血倾向、慢性病原体感染活动期、孕妇Rh阴性血型等);
③孕20+6周以上,错过血清学筛查最佳时间,但要求评估21-三体综合征、18-三体综合征、13-三体综合征风险者
3.慎用人群有下列情形的孕妇进外周血胎儿染色体非整倍体行检测时:检测准确性有一定程度下降,检出效果尚不18NIFIY/NIPT(T
21、T18和T13)高通量测序明确;或按有关规定应建议其进行产前诊断的情形包检测括
①早、中孕期产前筛查高风险;
②预产期年龄235岁;
③重度肥胖(体重指数>40或体重>100千克);
④通过体外受精一一胚胎移植方式受孕;
⑤有染色体异常胎儿分娩史,但除外夫妇染色体异常的情形;
⑥双胎及多胎妊娠;
⑦医师认为可能影响结果准确性的其他情形
4.不适用人群有下列情形的孕妇进行检测时,可能严重影响结果准确性包括
①孕周G2+0周;
②夫妇一方有明确染色体异常;
③1年内接受过异体输血、移植手术、异体细胞治疗等;
④胎儿超声检查提示有结构异常须进行产前诊断;
⑤有基因遗传病家族史,或提示胎儿罹患基因病高风险;
⑥孕期合并恶性肿瘤;
⑦医师认为有明显影响结果准确性的其他情形
1.辅助诊断HIV抗体检测结果不能进行明确诊断人获得性免HIV-119时,RNA的测定结果可帮助提供IIIV感染早期或终末期疫缺陷病毒感染RNA检测的证据如HIV感染母亲所生小于18个月龄的婴儿,20的个体化分子检测HIV耐药基因检测不同时间的两次HIV核酸检测均为阳性即可作出诊断
2.指导抗病毒治疗及疗效判定如果有条件,在治疗前作基线病毒载量检测是有必要的,便于观察抗病毒治疗后病毒抑制效果开始治疗16周时,所有初次抗病毒治疗患者的病毒载量应低于检测下限,如治疗6个月后,病毒载量仍没有低于检测下限,应结合临床仔细需找原因依从性、药物相互作用等,以考虑是否治疗失败及调整治疗方案治疗开始后应每半年检测一次病毒载量,评估治疗效果,如载量出现变化,应结合临床寻找原因及时调整治疗方案
1.新诊断的患者不管患者是否会很快进行抗病毒治疗都主张在确诊后先进性耐药检测已经证实耐药HIV毒株能够传播给从接收过治疗的患者,使这些患者从一开始就获得原发性耐药,被称为传播耐药传播耐药和患者的治疗失败有关,对这类患者进行耐药检测有助于选择能够取得最大病毒抑制效果的治疗方案
2.接受抗病毒治疗患者对于接受抗病毒治疗的患者在改变抗病毒治疗方案时,病毒学应答失败HIVRNA1000copies/mL或病毒抑制不理想时都应进行耐药检测,以判断是否发生耐药以及对哪种药物耐药,从而指导选择有活性的抗HIV药物进行后续治疗对于HIVRNA为500-1000copies/mL的患者,耐药检测的难度比较大,但仍应尽量进行;对V500copies/mL的患者则不建议进行耐药检测
3.孕妇所有孕妇在开始抗病毒治疗前都应进行基因型耐药检测,抗病毒治疗的目的是最大程度降低血浆病毒载量并预防HIV母婴传播,首要目的是取得最大程度的病毒抑制所以孕妇开始抗病毒治疗前应进行基因型耐药检测,对已接受治疗而HIVRNA仍能检出的孕妇也应进行耐药检测
4.耐药只是治疗失败的可能原因之一,并且与其他导致治疗失21华法林药物代谢基因CYP2C9和VK0RC1多态性22细胞色素P4502C9CYP2C9基因分型*1/*
2、*1/*3*2/*
2、*2/*
3、*3/*3维生素K环氧化物还原酶复合体1VK0RC1-1639GA基因分型:GG、GA、AA败的因素,包括药物的抗病毒活性不足、服药依从性差及个体药物代谢动力学差异等密切相关因此不能孤立地看待耐药检测结果,而应将其放在病毒载量和CD4+T淋巴细胞计数的变化、临床表现及其他检验项目改变的背景下分析耐药检测结果的解释必须结合既往治疗史、血浆病毒载量的长期变化及依从性的程度
1.预测疗效
2.个体化用药CYP2C9+VK0RC1多态性检测可以在使用华法林之前,根据国际公认的华法林剂量计算公式针对每个不同个体测算华法林的初始用量,为指导临床制定个体化用药方案提供重要参考氯毗格雷药物代谢基因23CYP2C19多态性伊立替康药物代谢基因24UGT1A1多态性他莫昔芬药25物代谢基因细胞色素P4502C19CYP2C19基因分型*1/*
1、*1/*
2、*1/*
3、*2/*
2、*2/*
3、*3/*
3、*2/*
17、*17/*17尿甘二磷酸葡萄糖醛酸转移酶1A1UGT1A1基因分型*1/*
28、*28/*28细胞色素P4502D6CYP2D6基因分型依据CYP2C19多态性的结果可以测定S-美芬妥英羟化酶在人体内活性的高低,从而判断氯毗格雷等心血管抗凝药物,苯妥英、丙戊酸等抗癫痫药物,奥美拉嗖等质子泵抑制剂类药物以及伏立康嗖等抗真菌类药物在体内代谢活性的高低,为指导临床制定个体化用药方案提供重要参考
1.预测疗效
2.UGT1A1基因型的检测可用于临床预测与伊立替康CPT-11相关的严重毒副作用的发生
1.预测疗效
2.不同患者间CYP2D6活性有很大差异,最大可达1000倍,这种差异是导致个体对药物疗效迥异的遗传学基础CYP2D6多态性为指导临床制定性个体化用药方案提供重要参考1慢性粒细胞白血病26BCR-ABLlp210(ChronicMyelogenousLeukemiaCML)是一种发生于造血干细胞的血液系统恶性克隆增生性疾病90%以上的CML患者的血细胞中出现Phi染色体t(9;22)(q34;qll)9号染色体长臂上C-abl原癌基因易位至22号染色体长臂的断裂点集中区(bcr)形成bcr/abl融合基因此基因产生一种新的mRNA编码的蛋白为BCR-ABL1融P210P210具有增强酪氨酸激酶的活性,改变了细胞合基因检测BCR-ABLlpl90多种蛋白质酪氨酸磷酸化水平和细胞微丝机动蛋白的功能,从而扰乱了细胞内正常的信号传导途径,使细胞失去了对周围环境的反应性,并抑制了凋亡的发生BCR-ABL融合基因检测对于前期CML疾病辅助诊断及后续靶向用药指导及残留病监测方面亦具有临床意义
2.资料显示,P190刺激细胞增殖的能力比p210要强,病情发展快,恶性程度更高用于检测体细胞突变的NGS正在广泛用于肿瘤诊疗相关的分子检测,体外检测人体组织中肿瘤细胞中肿瘤相关基因变异,包括对特定基因的DNA/RNA进行测序,实体肿瘤体细胞突变高通量/以寻找与肿瘤临床诊疗相关的突变基因的改变肿瘤基测序检测因突变类型包括点突变、插入、缺失、基因重排、拷贝数异常等广义的基因突变实体肿瘤体细胞突变检测用于肿瘤的监测、预后肿瘤游离DNA(ctDNA)基因突变检测对肿瘤靶向/肿瘤游离DNA基因突变检测治疗、早期治疗应答评估和耐药监测的实时评估等都具有一定的临床应用价值由于组织样本的局限性,临床上逐渐开始使用患者血浆中的游离DNA进行肿瘤基因突变的检测对表皮生长因子受体EGFR突变型的进展期肺癌来说,分子靶向药物疗效优于含伯类二联化疗方案,EGFR基因突变的检测能为肺癌患者靶向药物治疗提供依据,肿瘤游离DNAEGFR基因突变而大部分肺癌患者确诊时已处于肿瘤晚期,已失去手术检测切除机会,无法获得足够肿瘤标本进行EGFR基因突变的检测寻找替代肿瘤组织的EGFR基因突变检测标本,对于晚期患者来说具有重大的意义通过外周血游离DNA检测EGFR突变指导靶向药物治疗提供依据
1.预测疗效
2.他汀类药物是目前最有效的降低辛伐他汀药物转运体基因LDL-C水平从而降低心脑血管疾病风险的药物但是不SLC01B1分型有机阴离子转同个体对不同他汀类药物的反应不同,导致差异的关键运多肽1B1SLC01B1基因分因素是他汀类药物在肝脏代谢和转运的遗传特性不同型521TT、521TC、52ICC检测他汀类药物SLC01B1多态性可以指导临床用药
1.预测疗效
2.CYP3A5是他克莫司的代谢酶,CYP3A5基因多态性影响CYP3A5酶的表达继而影响他克他克莫司药物代谢基因莫司的代谢对于含有CYP3A5*3等位基因的患者应用CYP3A5分型细胞色素他克莫司应较常规降低用量,以减少不良反应;含P4503A5CYP3A5基因分型CYP3A5*1等位基因的患者应适当增加服药次数,以减*1/*
3、*3/*3少剂量不足导致的排斥反应,检测CYP3A5多态性有助于提高他克莫司的疗效先天性耳聋导致的原因有遗传、药物、感染、疾先天性耳聋基因测序病、环境噪声污染及意外事故等,其中遗传因素导致的听力丧失占了50%以上遗传性听力丧失根据是否伴有、虫山口龙廿4耳外组织的异常或病变可将其分为综合征性听力丧失遗传性耳聋基因测序syndromichearinglossSHL和非综合征性听力丧项目示例,也希望通过这些示例可以给各级医疗系统提供一些项目开展的思路和方向
一、病原体检测PCR技术的问世使病原体检测能够快速、方便地进行由于PCR技术假阳性率太高,只要有微量病原体存在就可得到阳性结果,这并不能作为诊断依据,只有当一定数量的病原体存在时才有临床意义因此,对模板准确定量显得特别重要,应用荧光技术PCR就能够快速、准确地得到结果对于解决免疫学检测的“窗口期问题,判断疾病是否处于隐性或亚临床状态,以及抗体检测不能判定是现症感染还是既往感染时,均可利用PCR进行确定示例新型冠状病毒核酸检测方法学荧光PCR法用途用于体外定性检测新型冠状病毒感染的肺炎疑似病例、疑似聚集性病例患者、其他需要进行新型冠状病毒感染诊断或鉴别检测基因新型冠状病毒2019-nCoVORFIab和N基因、E基因失nonsyndromichearinglossNSHL其中NSHL占70%以上NSHL根据遗传方式可分为常染色体隐性遗传性耳聋、常染色体显性遗传性耳聋、X连锁遗传性耳聋、Y连锁遗传性耳聋和线粒体遗传性耳聋,其中75—80%为常染色体隐性遗传,10—20%为常染色体显性遗传,X连锁和线粒体遗传不到2%迄今为止,158个非综合症性耳聋位点已定位,包括57个常染色体显性位点、77个常染色体阴性位点、7个X-染色体连锁位点、2个修饰位点、1个Y-染色体位点和14个线粒体位点通过位置克隆的方法已确定53个致病基因,包括27个常染色体隐性基因、21个常染色体显性基因、1个X-染色体连锁基因和4个线粒体基因在这些基因中,GJB2SLC26A4和线粒体12SrRNA基因的研究比较深入,不同种族和不同的人群存在不同的突变形式和突变频率,是我国最主要的致聋基因新生儿耳聋基因检测辅助诊断先天性耳聋和遗传性耳聋3536人类白细胞抗原HLA基因分型37人类白细胞抗原HLA-A、B、-DRB1低分辨基因分型LowResolutionGenotyping人类白细胞抗原HLA-A、B、-C、-DRBK-DQB1低分辨基因分型人类白细胞抗原HLA-A、B、-C、-DRB
1、-DQB1高分辨基因分型目前公认的与骨髓移植造血干细胞移植效果最密切的三个功能基因,它们具有高度多态性,在不同地域及种族之间存在分布差异,因而在人类遗传学、法医学和疾病相关性研究等多个领域中均具有重要的研究意义和应用价值人类细胞抗原基因系统根据编码分子的分布与功能不同,分为I、口、HI3大类HLA-A、B、C属于I类基因,HLA-A、B、DRB1基因是早期研究的与造血干细胞移植密切相关的3个功能基因随着非血缘造血干细胞移植的增加,HLA-C、DQB1基因在造血干细胞移植中的重要性日益受到重视国外的造血干细胞移植均对供患者进行HLA-A、B、C、DRB1和DQB1高分辨基因配型9696以上强直性脊柱炎HLA-B27基因抗原阳性,且有遗传倾向IILA-B*57:01等位基因与阿巴卡韦(AbacavirABC)所致的超敏反应(HSR)有密切关联,在服用ABC的HSR患者中,HLA-B*57:01等位基因的携带率为
94.4%o人类白细胞抗原(HLA)基因与多种药物不良反应有密切的相关性其中针对HLA-B*58:01和HLA-B*15:02等位基因在服用别喋吟醇药物后出现的严重不良反应患者中,100%东南亚地区的患者中存在HLA-B*58:01等位基因;而在服用卡马西平药物后出现严重不良反应的患者中,至少75%的东南亚地区的患者中存在HLA-B*15:02等位基因;在未出现不良反应的患者中(耐受人群)和正常对照组中,其携带率大约为15%和20%在使用这两种药物后携带HLA-B*58:01和HLA-B*15:02的个体较未携带这两种等位基因的个体出现严重毒副作用的机率显著增加在服用别喋吟醇和卡马西平药物之前,国际权威的一些相关治疗指南大都推荐进行HLA-B*58:01和HLA-B*15:02等位基因的检测,以判断是否属于高危人群,以有效降低由该药物引起的严重不良反应地中海贫血(THAC)主要分部在我国海南及两广沿海地区重症a地中海贫血可导致死产、死胎,影响孕妇健康重症B地中海贫血表现为严重溶血性贫血肝脾肿大,患者未到成年己夭折地中海贫血杂合子临床症状轻且可无症状夫妇双方携带将有1/4生育重症地中海贫血儿的可能地贫基因分型用于-地贫的诊断,地贫基因分型用于6-地贫的诊断CYP2c9*
1、*
2、*
3、*
8、44细胞色素P4502c9基因分型检测39种细胞色素P4502C9CYP2C9等位基因allele*
11、*
23、*
34、*
40、*
45、*
50、*
55、*
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14、*
16、*
19、*
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29、*
31、*
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43、*
44、*
46、*
47、*
48、*
49、P4502C9是人体中重要的药物代谢酶,P4502c9基因编码区的多态性造成氨基酸序列的变化P4502c9的底物包括甲苯磺丁胭、苯妥英、S2法华令、氟西汀、洛沙坦等P4502C9可被利福平诱导被胺碘酮和氟康嚏等多种药物抑制*
51、*
56、*
52、*
58、*
53、*
59、*
54、*60标本类型上呼吸道标本咽拭子、鼻拭子;下呼吸道标本呼吸道抽取物、肺泡灌洗液样本、肺组织活检标本检测流程
(1)核酸检测前的生物安全防护(工作人员个人三级防护的穿戴)一
(2)样本的灭活(56(灭活30分钟)一
(3)样本的核酸提取(手工、核酸提取仪)一
(4)PCR体系的配制和模板加样一
(5)上机检测及结果分析一
(6)检测后的消毒其他病原体检测HIV、甲乙丙肝、HPV、淋球菌、巨细胞病毒、沙眼衣原体、肺支、肺衣、EB病毒、腺病毒、胞病毒、手足口、甲乙流、埃博拉病毒、B族链球菌、HIV-1RNA检测、HIV耐药基因检测适合开展的医院二三甲综合医院、人民医院、中医院、妇幼、结核病医院、传染病医院、第三方、各种级别的有需求的医院
二、遗传病检测V基因突变和拷贝数变异是遗传病发生的主要遗传学基础,也是遗传病检测的主要靶标遗传病的复杂性伴随着基因突变数目多、类型广;基因拷贝数变异不仅表现为缺失和复制,而且缺失位置、大小以及复制倍数都呈现多样性遗传变异的复杂性为遗传病的临床检测提出了技术挑战实时PCR技术是我们最近发展起来新一代实时PCR技术,利用荧光标记或熔点分析,可以在单个反应管内检测多个靶标示例人Y染色体AZF区微缺失检测方法学荧光PCR法用途本产品用于定性检测男性全血样本中丫染色体无精子症因子azoospermiafactorAZF区域是否存在缺失,具体检测缺失位点为AZFa:sY
84、sY86;AZFb:sY
127、sY134;AZFc:sY
254、sY255;AZFd:sY
145、sY152o临床研究表明,Y染色体AZF区AZFaAZFbAZFcAZFd不同程度的缺失可导致男性的少精症、无精症或精子畸形等症状,从而导致男性不育本试剂盒可辅助诊断确诊不孕不育患者的病因分析,检测结果仅供临床参考,不能单独用做确诊或排除病例等临床诊断的依据标本类型全血检测流程1样本处理及DNA提取在标本制备区完成一2样本处理及DNA提取在标本制备区完成13加样(在标本制备区完成)T
(4)PCR扩增(在扩增区完成)一
(5)结果分析与判定豆病(G6PD).脊髓型肌萎缩(SMA)进行性肌营养不适合开展的医院和科室二三甲综合医院、人民医院、中医院、妇幼、第三方、各种级别的有需求的医院
三、个性化用药药理学和药物基因组学的发展,阐明了药物代谢和效应个体差异的遗传本质,药物异常反应主要是因为药物代谢酶基因变异而导致酶活性异常,进而导致服药后体内药物未能被正常代谢、消除而排出体外,使得体内药物浓度过高或过低,达不到理想的治疗效果这种异常药物反应,可通过检测与患者所服用药物相关的遗传基因,调整药物剂量或寻找替代药物,最大程度地制定出更合理、有效、经济的药物治疗方案示例心血管个体化用药指导检测CYP2C19基因突变检测试剂盒、CYP2c9基因突变检测试剂盒、ALDH2基因突变检测试剂盒、MTHFR基因突变检测试剂盒方法学荧光PCR法用途氯叱格雷、华法林、硝酸甘油及叶酸均为心血管临床上常见的药物,心血管用药指导分子生物学检测,明确基因分型,药学部临床药师根据检测结果,并综合考虑患者自身因素、临床诊断以及联合用药等相关信息,为临床出具个体化用药建议标本类型全血(本试剂盒无需提取DNA加样直接PCR)o检测流程
(1)配制反应体系(在样本准备区完成)一
(2)直接加入全血(在标本制备区完成)-
(3)PCR扩增(在扩增区完成)一
(4)结果分析与判定(ADRB1).儿童安全用药.肿瘤靶向化疗个性化用药EGFR.kRAS类适合开展的医院和科室心血管医院.肿瘤医院.第三方.各种级别的有需求的医院肿瘤是危害人类健康的一种疾病,它的恶性程度与预后判断主要依靠是否有转移和病理切片分期随着分子生物学的迅猛发展,肿瘤研究领域的大量研究成果显示,肿瘤的发生、发展、治疗和预后与肿瘤细胞内部基因和肿瘤相关病毒有关很多原癌基因和抑癌基因的表达情况的检测都可揭示了癌变的可能性,而PCR方法学可以解决此类问题,此外,PCR方法用于体外定性检测人外周血血浆中septin9基因甲基化,用于各种肿瘤的临床辅助诊断标本类型全血/组织检测流程
(1)PCR反应体系构建(在试剂准备区完成)
(2)样本处理及DNA提取(在标本制备区完成)一
(3)亚硫酸盐转化(在标本制备区完成)一
(4)PCR扩增(在扩增区完成)一
(5)结果分析与判定:SH0X2基因.RASSF1A基因.SDC2因.RNF
180.her2o适合开展的医院和科室肿瘤医院、第三方、各种级别的有需求的医院l.IIBVDNA是乙肝病毒存在直接的依据,IIBVDNA乙型肝炎病毒核酸HBVDNAHBV-DNA阳性是患者具有传染性的标志,HBV-DNA对乙肝两对半起补充作用
3.HBV-DNA是目前判断乙肝抗病毒药物疗效敏感的指标,评价乙肝病毒复制水平、传染性强弱的指标
4.HBV-DNA可检测出隐匿性慢性乙型肝炎
1.HCV是输血后肝炎和散发性非甲非乙型肝炎的主要病原,HCV感染可导致慢性肝炎、肝硬化和肝细胞癌等多种肝脏疾病
2.HCV-RNA检测用于丙肝病毒感染的早期诊断,鉴别丙肝病毒的活动性和复制程度
3.HCV-RNA定量可及时估计应答情况、及时调整疗程以及指导用药,为疗效2丙型肝炎病毒核酸HCVRNA观察及预后判断提供客观指标
4.弥补ELISA方法的高漏检率,HCV-RNA可作为HCV感染诊断的指标
5.抗-HCV阳性而血清中没有HCV-RNA提示既往感染,在血清中检测不到HCV-RNA并不意味着肝脏没有病毒复制
6.免疫功能低下,抗-HCV阴性仍可检测到HCV-RNA此类患者适宜采用HCV核心抗原或抗原-抗体联合检测试剂进行检测L结核杆菌感染的快速诊断,结核杆菌因其培养周期长,临床很难采用培养方法进行结核杆菌感染的快速诊断,而采用PCR方法,则可以做到这一点,如通过对痰、血液、淋巴液、脑脊液、胸腔积液、腹水等标本中核酸检测结核杆菌结核杆菌的PCR检测,可快速诊断肺结核、结核杆菌菌3(非病毒)TBDNA血症、淋巴结合、结核性脑膜炎、结核性胸腹膜炎等
2.抗结核治疗的监测,在抗结核治疗中,采用PCR方法定期检测,可评价抗结核药物的疗效
3.要注意临床“假阳性”问题,PCR检测的是病原体核酸,不管结核杆菌是否为活细菌,PCR均能检出,在经抗生素治疗一个疗程后,建议两周后再做PCR检测,以避免临床假阳性
1.结果呈现阳性时表示存在CT相关病原体核酸在排除以下儿种因素后可确诊为CT感染:
①在CT的诸多检测手段中PCR方法所检测靶物质为核酸不受标本生物活性的限制对于已经死亡的病原体仍可检测出来,即感染后药物治疗有效的情况下,患处仍会有少量已死亡的病原体存在应在停药2周后进行检测,若在用药期间进行病情的监测,则应与临床症状相结合必要时应用培养方法进行确诊
②PCR反应检测的靶物质为核酸,沙眼衣原体CTDNA如果操作不慎造成样本之间的污染,则可能出现假阳性的情况需要样本的运送和操作都要严格按照规程进行
2.当检测结果呈现阴性时表示无CT感染但仍需要排除以下几种因素:
①排除PCR抑制物导致的假阴性现象在结果的认定上需要注意
②耐药引起的基因突变也会导致扩增的失败,出现假阴性结果在临床体征和症状很明显而多次PCR检测均阴性的情况下要考虑这种情况的发生NGDNA检测对淋病的早期诊断、治疗、防止慢性感染有重要价值细菌培养尽管是“金标准”,但烦琐费淋球菌时,临床采用实时荧光PCR方法可很好的解决淋病奈瑟NGDNA菌感染快速诊断的问题尤其适用于泌尿生殖道感染的早期诊断及无症状的携带者的检测nrv广泛存在人类的npv感染率很高在临床上,人乳头瘤病毒-HPV-
6、-1K根据HPV亚型致病力大小或致癌危险性大小不同可将-
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35、-HPV分为低危型和高危型两大类低危型HPV主要引起
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51、-肛门皮肤及男性外生殖器、女性大小阴唇、尿道口、阴。